USB Type-C 与 USB 3.1 某种程度上是不同的东西。 USB Type-C 虽然是 USB 3.1 标准的一部分，但 USB Type-C 这个规范，其实是在定义连接器的介面样式，USB 3.1 却是一套传输标准。对消费者来说，USB Type-C 可视为一枚接头的「外型」，而这个「外型」则可以内嵌不同的传输标准，例如 USB 3.1，Thunderbolt 3。
一个传输标准为 Thunderbolt 3 的 USB Type-C 接孔，如果连接上支援 Thunderbolt 3 的外接硬碟，则可以达到40GB/s传输速度。由于 Thunderbolt 3 也向下相容 USB 3.1，因此 USB Type-C 也可以插 USB 3.1 的外接硬碟，不过速度会下降10GB/s（USB 3.1 的理论速率） 。若是反过来，在一个 USB 3.1 传输标准的 USB Type-C 接孔插上 Thunderbolt 3 的外接硬碟，则因规格不支援无法使用。